Sephiroth foi um Soldado de alto escalão uma lenda viva conhecida em todos os cantos do Planeta. O mais poderoso e habilidoso lutador que já houve, alto, com um longo cabelo prata, olhos verde esmeralda, uma longa capa preta, e ombreiras metálicas Desde cedo ingressara na SOLDIER e logo se tornara o soldado mais promissor e habilidoso da divisão que era a força bélica mais temida no mundo. Como o único capaz de manejar a lendária
espada Masamune (pela peculiaridade que sua lãmina tem dois metros de comprimento),ele era tido como uma pessoa gentil e fria que exibia ar totalmente melancólico,era o tipo de pessoa que ninguém jamais viu sorrindo, muitos admiraram ele.
A missão final de Sephiroth para a Shinra foi investigar um reator Mako em Nibelheim nas montanhas. Quando lá em Nibelheim, Sephiroth revela que ele nunca teve propriamente uma família, sua mãe, cujo nome era Jenova, morreu após dar a luz a ele, Sephiroth nunca havia mencionado nada sobre um pai, mas ele disse que não tinha cidade natal. Falar de tal fato era a única coisa que lhe arrancava a compostura, por motivos que nem o próprio Sephiroth entende ele sentia um êxtase inexplicável ao se recordar de tudo referente à sua mãe e começava a gargalhar sem motivo algum.
Chegando ao reator para o qual fora designado e entrando nele Sephiroth descobre cápsulas contendo monstros, ele disse que eles já haviam sido humanos uma vez, mas que foram expostos há uma grande quantidade de energia Mako, então sofreram mutação. Ele também diz que aos soldados Shinra eram dadas pequenas doses dessa Mako energy dando à eles mais poder. Junto com as cápsulas havia uma câmara no topo com a palavra Jenova cravada, Sephiroth viu que este era o mesmo nome de sua suposta mãe, e então começou a pensar. Ele não era um soldado qualquer, ele era o mais poderoso e forte SOLDIER(soldado) do exército Shinra, isto o deixou curioso sobre se ele havia sido "criado" da mesma maneira que os seres nas cápsulas (já que Jenova era guardada num altar próxima deles), seria ele um desses experimentos? Os arquivos Sephiroth eram ultra-secretos, guardados em algum lugar. De alguma maneira Sephiroth sabia da biblioteca escondida na mansão da Shinra (lá em Nibelheim) e decide ir até lá e encontrar suas verdadeiras origens. Sephiroth desapareceu por dias na biblioteca da Shinra Mansion, lendo tudo o que podia encontrar e que poderia estar conectado com o que realmente ele era. Ele acabou encontrando duas coisas que poderiam ser importantes, sobre os Antigos e Projeto Jenova. Ele descobriu que foi criado através do Jenova Project, e que Jenova era de fato sua mãe. Mas havia um pouco mais sobre o Projeto.
Ele começou quando cientistas encontraram um organismo de 2000 anos de idade que foi identificado como sendo uma forma de vida relacionada aos Antigos Cetra. Isto foi nomeado Jenova. Os Cetra eram uma antiga raça de pessoas que viviam no planeta antes dos humanos. Eles tinham poderes especiais e podiam se comunicar com o planeta. Quando eles morriam então iam para a Terra Prometida, um lugar o qual Shinra imaginava que estaria cheio de energia Mako, então claramente estavam dispostos a encontrá-lo. Eles designaram três cientistas para trabalhar no Jenova Project, onde eles iriam recriar um Cetra com as células de Jenova. Shinra queria recriá-los para que os levasse até a Terra Prometida. E através deste projeto Sephiroth foi criado.
Sephiroth também leu sobre os Ancients, e viu que o planeta uma vez pertenceu aos Cetra. Mas uma crise atingiu o planeta, e pôs tudo e todos em perigo. Alguns dos Cetras fugiram do perigo deixando o resto para morrer, mas salvando o planeta. Os Cetras "covardes" que sobreviveram são os ancestrais da humanidade. Desde que Sephiroth era o filho de Jenova, que era uma Cetra, ele acreditou que era o legítimo herdeiro do planeta, e como os humanos eram traidores (desde que seus ancestrais eram Cetras que fugiram da crise) deveriam ser punidos pelo que fizeram e então retornar o planeta aos seus donos de direito, ele e sua mãe Jenova.
Uma vez descoberto o que achava que era a verdade sobre si, Sephiroth foi tomado por raiva e ódio que recairiam sobre a humanidade, queimando a vila de Nibelheim e subjugando todos lá (exceto Cloud, Tifa e Zack) ele então prosseguiu para o tal reator Mako afim de se reunir com sua mãe. Dentro do reator tanto Tifa e Zack tentaram pará-lo mas falharam, então Cloud o golpeou por trás, naturalmente Sephiroth esquivou-se de Cloud com sua masamune, mas não era o fim, Cloud de alguma forma conseguiu empurrar Sephiroth que caiu no fundo do poço de Mako do reator. Após este evento, havia sido reportado que Sephiroth tinha morrido. Shinra então decidiu levar Jenova para seu quartel general e dar continuidade aos seus experimentos.
Cinco anos depois, alguém atacou a Shinra e roubou Jenova de sua câmara, esta pessoa matou a todos lá incluindo o presidente Shinra, que foi encontrado com uma espada em suas costas... Cloud identificou esta pessoa como sendo Sephiroth, pela espada masamune, já que Sephiroth era o único no mundo que sabia utilizá-la daquele jeito. Mas foi dito que Sephiroth estava morto?! Bem, não exatamente, a energia Mako é realmente o Lifestream(o fluxo da vida) do planeta, a força que mantêm ele vivo (ou Shinra não sabe disso, ou eles realmente não ligam) e após Sephiroth cair no poço de Mako, ele foi carregado pelo Lifestream até o centro do planeta (ou quase) e acabou encapsulado em puro Mako na Northern Crater ou Cratera Norte. Lá inconscientemente continuou com seus planos, apenas com o poder de sua mente (e também com ajuda das células Jenova) ele controlou vários clones de si, vários Sephiroths (ou algum tipo de manifestações de seu eu) para procurar a Terra Prometida, a qual achava ser o lugar onde os Cetra iam para se tornarem um só com o planeta. Ao mesmo tempo ele também procurava uma maneira de punir a raça humana por serem "traidores".
Sephiroth viajou através do mundo, e finalmente chegou ao Templo dos Antigos, onde ele absorveu os conhecimentos dos Antigos Cetra e criou seu grande plano.Ele usaria algo chamado Black Materia, com isto, invocaria The Meteor, a mais poderosa força conhecida. Quando Meteoro atingisse o Planeta ele ficaria tão ferido que uma imensa quantidade de Lifestream (Energia Mako) seria liberada para a cura do planeta.Sephiroth iria esperar nessa ferida emergindo-se em Lifestream e tornando-se um com o planeta. Isto iria tornar ele e Jenova os donos do planeta e no processo destruir tudo, incluindo os humanos como punição.
A única coisa que poderia parar Meteoro era Holy, contida na White Materia e que se equalaria em poder o bastante para salvar o Mundo da destruição. Aeris era a única que sabia disto (já que ela era a única verdadeira descendente dos Cetra) e pôsse à rezar pela força Sagrada(Holy). Mas Sephiroth mata Aeris enquanto esta está no meio da prece e continua com seus planos. Felizmente Aeris tinha feito o bastante.
É então chegada a hora do "despertar" de Sephiroth, como quase um Deus para purificar o mundo. Cloud e seus amigos mesmo assim enfrentam O Alado Sephiroth, opondo-se à sua vontade de destruição, e então finalmente conseguem detê-lo. Mas Cloud ainda não terminou com seu "ex-ídolo" Sephiroth, e é chamado para a batalha final no além, onde finalmente é posto um fim de uma vez por todas à alma de Sephiroth.
